| Servicio de la torre de patología, genética y genómica | Dirección de apoyo al diagnóstico y tratamiento | Subdirección de apoyo al diagnóstico y tratamiento "B" |
| Servicio de la Torre de audiología y foniatría, medicina mental y rehabilitación y alergia | Dirección medica | Subdirección médica "B" |
| Banco de sangre | Dirección de apoyo al diagnóstico y tratamiento | Subdirección de apoyo al diagnóstico y tratamiento "B" |
| Servicio de torre de cardiología, angiología y neumología | Dirección Quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Cirugía plástica y reconstructiva | Dirección Quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Clínica del dolor | Dirección Quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Consulta externa, admisión y archivo clínico | Dirección médica | Subdirección médica "A" |
| Departamento de cirugía experimental | Dirección de investigación | |
| Dermatología | Dirección médica | Subdirección médica "B" |
| Dirección general adjunta médica | Dirección general adjunta médica | |
| Dirección médica | Dirección general adjunta médica | |
| Dirección quirúrgica | Dirección general adjunta médica | |
| Dirección y subdirección de apoyo al diagnóstico y tratamiento | Dirección de apoyo al diagnóstico y tratamiento | |
| Departamento de pregrado | Dirección de enseñanza | |
| Dirección de investigación | Dirección de investigación | |
| Departamento de apoyo e impulso a la investigación | Dirección de investigación | |
| Dirección general | Dirección general | |
| Departamento de enfermería "A" | Dirección general adjunta médica | Subdirección de enfermería |
| Departamento de enfermería "B" | Dirección general adjunta médica | Subdirección de enfermería |
| Departamento de trabajo social | Dirección general adjunta médica | |
| Departamento de vigilancia epidemiológica | Dirección general adjunta médica | |
| Endocrinología | Dirección médica | Subdirección médica "B" |
| Estomatología (odontología) | Dirección quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Gineco-Obstetricia | Dirección quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Hematología y Oncología | Dirección quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Infectología | Dirección médica | Subdirección médica "A" |
| Laboratorio de análisis clínicos | Dirección de apoyo al diagnóstico y tratamiento | Subdirección de apoyo al diagnóstico y tratamiento "A" |
| Medicina Interna 108 | Dirección médica | Subdirección médica "B" |
| Medicina Interna 110 | Dirección médica | Subdirección médica "B" |
| Geriatría | Dirección médica | Subdirección médica "B" |
| Medicina Interna 308 | Dirección médica | Subdirección médica "B" |
| Medicina preventiva | | |
| Nefrología | Dirección médica | Subdirección médica "A" |
| Neurología y neurocirugía | Dirección quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Oftalmología | Dirección quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Ortopedia y traumatología | Dirección quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Otorrinolaringología | Dirección quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Pediatría | Dirección médica | Subdirección médica "A" |
| Radiología | Dirección de apoyo al diagnóstico y tratamiento | Subdirección de apoyo al diagnóstico y tratamiento "A" |
| Reumatología | Dirección médica | Subdirección médica "B" |
| Salud mental (psicología y psiquiatría) | Dirección médica | Subdirección médica "B" |
| Servicio de investigación farmacológica | Dirección de investigación | |
| Subdirección de enfermería | Dirección general adjunta médica | Subdirección de enfermería |
| Subdirección médica "A" y "B" | Dirección médica | |
| Torre quirúrgica | Dirección quirúrgica | Subdirección quirúrgica "B" |
| Urgencias médicas | Dirección médica | Subdirección médica "A" |
| Urología | Dirección quirúrgica | Subdirección quirúrgica "A" |
| Almacén médico | Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de almacenes |
| Contraloría | | |
| Auditoría Interna para el control quejas y responsabilidades | | |
| Órgano de control | | |
| Departamento de Seguridad y Departamento de protección civil | | Subdirección de vigilancia y protección civil |
| Departamento de control de asistencia | Dirección de recursos humanos | Subdirección de administración y desarrollo |
| Departamento de control y conciliación | Dirección de recursos humanos | Subdirección de operación |
| Departamento de adquisiciones | Dirección de recusros materiales y conservación | Subdirección de recursos materiales |
| Departamento de almacén de varios | Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de almacenes |
| Unidad jurídica | | Subdirección jurídica |
| Departamento de asuntos civiles y penales | | Subdirección jurídica |
| Departamento de control y ejercicio presupuestal | Dirección de recursos financieros | Subdirección de presupuesto y contabilidad |
| Departamento de contabilidad | Dirección de recursos financieros | Subdirección de presupuesto y contabilidad |
| Departamento de empleo y capacitación | Dirección de recursos humanos | Subdirección e administración y desarrollo |
| Departamento de equipo (Ingeniería biomédica) | Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de conservación y mantenimiento |
| Departamento de estadística y planeación | Dirección de planeación y desarrollo de sistemas administrativos | Subdirección de sistemas administrativos |
| Departamento de Ingresos | Dirección de recursos financieros | Subdirección de tesorería |
| Departamento de instalaciones especiales | Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de conservación y mantenimiento |
| Departamento de inventarios | Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de recursos materiales |
| Departamento de nutrición | Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de servicios generales y nutrición |
| Departamento de relaciones laborales | Dirección de recursos humanos | Subdirección de administración y desarrollo |
| Departamento de servicios generales | Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de servicios generales y nutrición |
| Departamento de servicios y prestaciones | Dirección de recursos humanos | Subdirección de administración y desarrollo |
| Departamento de información documental | Dirección de enseñanza | |
| Dirección de recursos materiales y conservación | | |
| Dirección de recursos financieros | | |
| Dirección de recursos humanos | | |
| Dirección general adjunta de administración y finanzas | | |
| Dirección de planeación y desarrollo de sistemas | | |
| Departamento de egresos | Dirección de recursos financieros | Subdirección de tesorería |
| Departamento de nóminas y pagos | Dirección de recursos humanos | Subdirección de operación |
| Departamento de obra civil | Dirección de recursos materiales y conservación | Coordinación de obra civil |
| Departamento de soporte técnico y redes | Dirección de planeación y desarrollo de sistemas administrativos | Subdirección de istemas administrativos |
| Dirección de recursos humanos | Subdirección de administración y desarrollo |
| Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de almacenes |
| Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de conservación y mantenimiento |
| Dirección de recursos humanos | Subdirección de operación |
| Dirección de recursos financieros | Subdirección de presupuesto y contabilidad |
| Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de recursos materiales |
| Dirección de recursos materiales y conservación | Subdirección de recursos generales y nutrición |
| Dirección de planeación y desarrollo de sistemas administrativos | Subdirección de sistemas administrativos |
| Dirección de recursos financieros | Subdirección de tesorería |
| Unidad de calidad y seguimiento | Dirección de planeación y desarrollo de sistemas administrativos | |
